藻蓝蛋白是水溶性色素，无反作用，纯蓝，清亮可爱，可作为食品着色剂。 而且本身是非常丰富的蛋白质，其氨基酸组成齐全，必需氨基酸占总量的37.2%。是美国FDA认可的天然蓝色色素。

　　随着大家对人工合成色素的质疑，消费者更青睐于添加有天然色素或标有 “非人造” “无污染”的食品。目前可食用的蓝色素种类很少，来源也非常有限。在我国 GB2760 － 2011 《食品添加剂使用卫生标准》中列出的可添加在食品中的蓝色素只有栀子蓝色素和藻蓝蛋白 ( 即藻蓝素) 、靛蓝 3种。藻蓝蛋白被食品专家形象地誉为"食物钻石"。

　　藻蓝蛋白属于天然蓝色素，都可由植物提取加工而成。靛蓝有天然的也有人工合成的，现工厂化生产的较多为人工合成靛蓝。众所周知天然色素具有安全，营养，保健等特点，而人工合成色素容易在合成过程受到重金属等有毒化学物质的污染，会对人体造成各种不良影响。